<<
>>

1.1 ABCA1 транспортер

ABCA1 относится к суперсемейству АТФ-связывающих кассетных транспортеров, которое представляет собой одно из наибольших семейств белков в живых организмах. Оно включает 49 генов, кодирующих ABC транспортеры у человека, 52 у мыши, 56 у Drosophila, 58 у Caenorhabditis elegans, 31 у дрожжей и 129 у Arabidopsis (Holland et al., 2003).

Впервые ABC транспортер был клонирован в 1982 (Singaraja et al., 2003). ABC транспортеры млекопитающих разделены на 7 структурных классов, или подсемейств на основе их аминокислотной последовательности и доменной организации: ABCA, ABCB, ABCC, ABCD, ABCE, ABCF, ABCG. Подсемейство транспортеров ABCA, в свою очередь, представлено 12 кодирующими генами: ABCA1 (9q22-q31), ABCA2 (9q34), ABCA3 (16p13,3), ABCA4 (1p22), ABCA7 (19p13,3), ABCA11 (4p16), ABCA12 (2q35) и ABCA5, ABCA6, ABCA8, ABCA9 и ABCA10, локализованными в локусе 17q24 (Dean et al., 2001). ABC транспортеры характеризуются двумя высоко консервативными гидрофильными цитоплазматическими нуклеотид-связывающими доменами (NBD) и двумя гидрофобными трансмембранными доменами (TMB), содержащими 6-12 трансмембранных а-спиралей. Субстратами для ABC транспортеров являются липиды, желчные кислоты, ксенобиотики, ионы тяжелых металлов, неорганические кислоты, конъюгаты глутатиона, сахаров и белков для презентации антигена (Rea et al., 1998).

Ген АВСА1 локализован на длинном плече хромосомы 9 в локусе 9q31. Его открытая рамка считывания состоит из 6783 п.н. и содержит 50 экзонов. АВСА1 - трансмембранный белок, молекула которого состоит из 2261 аминокислотных остатков (Рисунок 2) (Oram, Heinecke, 2005).

Рисунок 2. Схематическое изображение белка АВСА1 (Kang et al., 2010).


Белок АВСА1 состоит из двух трансмембранных доменов. Каждый домен содержит шесть гидрофобных трансмембранных спиралей. На N-терминальном конце белок АВСА1 содержит сигнальную последовательность (АК 1-60), которая ориентирует ABCA1 в бислойной мембране. Сигнальная пост-Гольджи последовательность (AA 9-14) служит для направления ABCA1 к везикулам. 11-5­8-14 мотив (AA 1245-1257) является сайтом связывания кальмодулина и связывание с кальмодулином защищает ABCA1 от калпаин-опосредованной деградации. PEST последовательность (АК 1245-1257) является мишенью для калпаин протеаз. NDF6F1 (АК 1311-1450) представляет собой последовательность аминокислот, которые используется для генерирования антител к ABCA1 и предполагается, что эта область имеет решающее значение для связывания ABCA1 с апо AI. Мотив VFVNFA (AA 2216-2221) является высоко консервативными среди ABCA транспортеров и играет важную роль в транспорте холестерина. PDZ белок связывающий мотив (AA 2258-2261) обеспечивает связывание с PDZ белками, включая а1 и pi-синтропином. Два нуклеотид связывающих домена (NBD) связывают и гидролизуют АТФ для транслокации субстратов через мембрану. Два ECD домена обеспечивают связывание с апо AI.

<< | >>
Источник: Демина Екатерина Петровна. Экспрессия генов транскрипционных факторов LXRalpha, LXRbeta, PPARgamma и транспортера ABCA1 при атеросклерозе. 2014
Помощь с написанием учебных работ

Еще по теме 1.1 ABCA1 транспортер:

  1. Демина Екатерина Петровна. Экспрессия генов транскрипционных факторов LXRalpha, LXRbeta, PPARgamma и транспортера ABCA1 при атеросклерозе, 2014
  2. 5.1 Технологическая линия для производства утеплительных плит из соломы зерновых культур
  3. 3.2.2. Конверсия целлюлозосодержащего и пентозансодержащего сырья концентрированными кислотами
  4. Технологическая схема подготовки гидролизата.
  5. АЛЮМИНИЙ ИЗ ОСТАТКОВ НА СТЕКЛОТКАНИ, ОБРАЗУЮЩИХСЯ В ПРОЦЕССЕ ФИЛЬТРОВАНИЯ
  6. ТИПЫ ТРАНСПОРТНЫХ СРЕДСТВ
  7. СВИНЕЦ ИЗ КОЛОШНИКОВОЙ пыли ПРОЦЕССА РАФИНИРОВАНИЯ ЦИНКА
  8. СВИНЕЦ ИЗ СТРЕЛЬБИЩНЫХ ПОЧВ
  9. ЖЕЛЕЗА ОКСИД ИЗ ШЛАМА, ОБРАЗУЮЩЕГОСЯ НА ПРОКАТНЫХ СТАНАХ
  10. СТАЛЬ ИЗ СТАЛЬНОГО ЛОМА
  11. ЦЕМЕНТ ИЗ ОСТАТКОВ ТОВАРНОГО БЕТОНА
  12. МЕДЬ ИЗ ЛОМА ЭЛЕКТРИЧЕСКИХ ПРОВОДОВ
  13. СТАЛЬ ИЗ АВТОМОБИЛЬНОГО ЛОМА
  14. СТЕКЛОВОЛОКНО ИЗ ОТХОДОВ СТЕКЛОВОЛОКНА
  15. ЦВЕТНЫЕ МЕТАЛЛЫ ИЗ АВТОМОБИЛЬНОГО ЛОМА
  16. ЖЕЛЕЗО ИЗ ПЕЧНОЙ ПЫЛИ СТАЛЕПЛАВИЛЬНЫХ ЗАВОДОВ
  17. Утилизация сгущённых осадков очистных сооружений.
  18. ФОРМОВОЧНЫЙ ПЕСОК ИЗ ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ЛИТЕЙНЫХ ФОРМ
  19. ОБОРУДОВАНИЕ ДЛЯ ПРИГОТОВЛЕНИЯ ФОРМОВОЧНЫХ И СТЕРЖНЕВЫХ СМЕСЕЙ
  20. СТЕКЛО из отходов слоистого СТЕКЛА